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dsh-aidd

工作流 更新于 2026.08.25

在终端中运行以下命令:

dsh plugin install PandaAIDD/dsh-aidd

将以下提示词粘贴到 DeepSeek Harness 对话框中:

在 DeepSeek Harness 中执行 dsh plugin install PandaAIDD/dsh-aidd 即可安装,完整源码地址为 https://github.com/PandaAIDD/dsh-aidd

插件介绍

做 AI 驱动药物发现,最头疼的往往不是模型本身,而是研究工作流的碎片化:虚拟筛选跑完了一堆 hit list,分子生成产出了几百个候选,ADMET 预测、DTI 建模的结果散落在不同脚本和日志里,事后想追溯「这个分数到底是怎么来的」几乎无从下手。dsh-aidd 把 AIDD 研究建模为一个结构化的 ReAct 循环——假设、实验、观察、结论、迭代,每一步都有明确的工具调用和状态持久化,让研究者可以跨会话、跨机器地续接工作。

在数据可追溯性方面,插件将 hit list、打分表、数据切分文件、模型 checkpoint 和指标表统一存储为带版本号的产物,每个文件附带 SHA-256 校验、生成命令、输入参数和环境快照,并维护一份只追加的 provenance 日志。同时内置了 AIDD 数据纪律:随机种子必须固定并记录、scaffold 和 cold-start split 必须归档、同源靶点不得跨训练和测试集、未复现 baseline 不得声称改进——这些红线写入预置角色,从源头减少「好分数不等于好分子」的陷阱。

插件还打包了 17 项技能,覆盖虚拟筛选、分子生成、性质与 ADMET 预测、蛋白靶点建模、DTI 建模和模型复现等 AIDD 核心环节,以及研究循环、文献连接、科学评审等通用科研能力。它适合在 DeepSeek Harness 中做计算化学、分子设计或 AI 制药研究的个人和团队,尤其是需要多人协作、结果可审计、流程可复现的场景。

使用场景

  • 虚拟筛选后需要追溯 hit list 的生成条件与环境快照
  • 分子生成与 ADMET 预测结果散落在不同脚本中难以统一管理
  • 团队协作要求实验结果可审计、可复现
  • 需要结构化地推进假设到实验到结论的迭代循环

适合人员

  • 在 DeepSeek Harness 中做 AI 制药研究的计算化学师或生物信息学家
  • 需要多人协作和结果审计的分子设计或 AI 制药团队
  • 希望将 AIDD 工作流程结构化、可追溯的研究生或独立研究者