xby-anndata
在终端中运行以下命令:
dsh plugin install xby-skill/xby-anndata
将以下提示词粘贴到 DeepSeek Harness 对话框中:
在 DeepSeek Harness 中执行 dsh plugin install xby-skill/xby-anndata 即可安装该插件,项目仓库地址为 https://github.com/xby-skill/xby-anndata 。
插件介绍
单细胞组学和生物医学研究者日常处理大量 AnnData 对象,打开终端检查维度、查看各列分布、确认元数据信息往往打断分析节奏。xby-anndata 把 AnnData 对象的结构查询接入了对话界面,通过 MCP 协议让你直接在聊天中完成数据探查,无需反复切换窗口或敲命令。
核心能力覆盖四个场景:快速查看 AnnData 对象的原始数据;从本地文件或远程 URL 拉取对象摘要;对任意属性或属性值计算描述性统计(计数、均值、标准差、极值、频次分布等),且支持先过滤再统计。此外,API 密钥可在对话中一键配置并自动持久化,重启后依然有效。
适合正在使用 AnnData 格式做单细胞转录组、空间转录组或多组学整合分析的研究者和数据工程师。如果你希望把重复性的数据结构检查交给对话助手,把更多精力留给下游建模和可视化,这个插件能显著减少上下文切换成本。
使用场景
- 在对话中快速查看 AnnData 对象的结构与维度
- 对特定基因或细胞类型属性执行描述性统计
- 从本地文件或远程 URL 获取 AnnData 摘要
- 先按样本过滤再计算各属性的分布指标
适合人员
- 从事单细胞转录组或空间组学分析的研究者
- 处理 AnnData 格式多组学数据的数据工程师
- 希望在对话界面完成数据探查的生物信息团队