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dsh-crystal-viewer

dsh-crystal-viewer

客户端 更新于 2026.08.31

在终端中运行以下命令:

dsh plugin install Nth-5620/dsh-crystal-viewer

将以下提示词粘贴到 DeepSeek Harness 对话框中:

在 DeepSeek Harness 终端中执行 dsh plugin install Nth-5620/dsh-crystal-viewer 即可安装晶体结构可视化插件,源码位于 https://github.com/Nth-5620/dsh-crystal-viewer

插件介绍

在晶体结构解析与精修流程中,大量关键判断本质上是一次“看一眼”——单胞参数是否合理、空间群是否正确、R1 与 wR2 是否收敛、是否还有未指认的 Q 峰、配位几何是八面体还是平面四方。dsh-crystal-viewer 为 DeepSeek Harness 提供这样一个天然的检视窗口,让你在终端会话中不必切换工具即可快速做出这些判断。

插件基于改进版 3Dmol.js WebGL 渲染器,支持线条、棒状、球棍、CPK、配位多面体等多种原子显示风格,并能自动补全 SYMM 与 LATT 对称操作集,使 Fm-3m、Im-3 等高对称空间群渲染出完整单胞。三种填充模式(In Cell、Original、No Packing)让你在完整对称胞、原始坐标与真正非对称单元之间自由切换。右侧七组参数面板实时展示精修统计、单胞参数、对称信息、元素与原子计数以及前五大 Q 峰详情;Q 峰层作为独立可叠加图层随时开关。同时注册为 DSH 文件预览器,在文件树中点击 .cif、.ins、.res、.xyz、.mol、.pdb 文件即可直接在侧边栏中 3D 呈现。

该插件面向晶体学研究者及任何依赖快速视觉检视的结构解析与精修工作流。它纯粹是查看器而非计算引擎,不做精修或几何求解决策。所有解析与渲染均在本地完成,界面自动跟随 Harness 明暗主题切换。

截图预览

使用场景

  • 结构解析时快速检视单胞参数与对称空间群
  • 精修循环中判断 R1、wR2 是否收敛以及残留 Q 峰
  • 检查金属中心的配位多面体几何(八面体、平面四方、四面体等)

适合人员

  • 单晶 X 射线衍射与电子衍射研究者
  • MOF、配位化合物及金属有机框架结构解析人员
  • 需要即时 3D 检视的结构化学家与计算晶体学家