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dsh-ezprot-plugin

模型推理 更新于 2026.08.21

在终端中运行以下命令:

dsh plugin install YukunR/dsh-ezprot-plugin

将以下提示词粘贴到 DeepSeek Harness 对话框中:

在 DeepSeek Harness 中执行 dsh plugin install YukunR/dsh-ezprot-plugin 即可安装该插件,开源地址:https://github.com/YukunR/dsh-ezprot-plugin

插件介绍

蛋白质组学数据分析一直是一道门槛——归一化、批次校正、差异检验、通路富集,每一步都需要 R 脚本和终端操作,把大量不做生物信息学的研究者挡在门外。dsh-ezprot-plugin 把整条流水线压缩进一次对话:告诉 agent 数据文件在哪、样品分组是什么、要比较哪些组,它便从质控一路跑到最终解读报告,无需你写一行代码。

工作流覆盖表达分析全链路:数据质控与归一化、PCA 可视化、批次效应校正、差异蛋白分析、GO/KEGG 功能富集以及 GSEA 集合富集。每个阶段都会生成可读的摘要与图形,会话结束时输出一份解读报告,列出关键差异蛋白、富集通路和候选靶点,全程可见、可回溯。

首次使用时插件会自动检测并静默安装 R 4.4.0 运行环境及配套包库(约 10–20 分钟);若本地无法搭建 R,则自动切换 Docker 后端,甚至能在网络受限机器上完成一次性 GO/KEGG 后台构建,零手动配置。

手上有蛋白质组学原始数据和样品信息表,却不想花数周学 R、DESeq2 或 limma 的研究者,正是这个插件的受众——打开聊天窗口,描述你的分组,剩下的交给 agent。

使用场景

  • 拿到质谱原始数据后,想快速得到差异蛋白和富集通路结果
  • 没有R或生信背景,需要零代码完成表达分析全流程
  • 在网络受限环境下通过Docker后端跑完GO/KEGG富集
  • 对多个样品组进行系统比较并输出可解读的报告

适合人员

  • 持有蛋白质组学原始数据但缺乏R编程经验的湿实验生物学家
  • 需要快速产出差异蛋白与通路富集结果的临床研究者
  • 希望将表达分析流程嵌入AI对话工作流的实验室团队