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dsh-molbio-tools

客户端 更新于 2026.08.24

在终端中运行以下命令:

dsh plugin install lovy2004/dsh-molbio-tools

将以下提示词粘贴到 DeepSeek Harness 对话框中:

在 DeepSeek Harness 终端中执行 dsh plugin install lovy2004/dsh-molbio-tools 即可安装该分子生物学研究插件,源码地址为 https://github.com/lovy2004/dsh-molbio-tools

插件介绍

做湿实验的研究生和研究员每天都在十几个独立工具之间来回切换:SnapGene 看质粒图谱、Primer3 设计引物、在线工具算 GC 含量和 Tm、手动核对酶切位点、用表格跑 ΔΔCt 分析,上下文在浏览器标签页间碎片化,实验流程不断被打断。dsh-molbio-tools 把 44 个分子生物学纯计算工具嵌入 DeepSeek Harness 会话,用自然语言一句话就能驱动反向互补、六框翻译、90 余种限制酶位点扫描(含 IIS 型切点几何)、自动引物设计与 Primer3 对齐的结构筛查(自互补、发夹、二聚体、3'端稳定性、错配容差、目标位点偏好)、限制酶-连接 / Gibson / Golden Gate 组装模拟、环状感知的 Sanger 测序验证(支持 .ab1 质量值)、跨内含子 qPCR 引物设计、ΔΔCt 与标准曲线分析、渐进式多序列比对与保守性打分(v15)、密码子优化、蛋白质理化性质估算,以及从 SnapGene .dna 或 GenBank 文件一步生成 SVG 质粒图谱、虚拟琼脂糖凝胶图和文献/协议/实验日志管理。

所有工具均为确定性纯函数,返回结构化 JSON;生成图形时写入工作区文件并自动调用系统默认应用打开,避免大段 SVG 文本挤占模型上下文。插件以专属预设模式(Molecular Biology Lab)分发,44 个工具仅在该模式下可见,不会污染其他会话的场景。整个插件由纯 .mjs 文件构成,零构建、零运行时依赖,适合希望把分子生物学分析流水线压缩进单一对话工作流的研究团队和独立实验室。

使用场景

  • 设计 PCR 引物并自动筛查二聚体、发夹与 3' 端稳定性
  • 从 SnapGene 文件一步生成质粒图谱并模拟 Golden Gate 组装
  • 对 Sanger 测序结果做环状感知的错配比对与氨基酸后果分析

适合人员

  • 从事分子克隆与 qPCR 实验的研究生和博士后
  • 需要统一管理引物设计、酶切模拟与图谱生成的独立实验室
  • 希望将分子生物学分析流水线嵌入 AI 对话工作流的研究团队