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dsh-seq-viewer

客户端 更新于 2026.10.20

在终端中运行以下命令:

dsh plugin install ZengZichao/dsh-seq-viewer

将以下提示词粘贴到 DeepSeek Harness 对话框中:

在 DeepSeek Harness 的插件页面执行 dsh plugin install ZengZichao/dsh-seq-viewer,或从 https://github.com/ZengZichao/dsh-seq-viewer 克隆后按 README 从本地目录安装,完成后重启对应 profile。

插件介绍

在生物信息学工作流里,序列比对往往散落在 FASTA、CLUSTAL、PHYLIP、Stockholm 等格式中。若只能在编辑器里看纯文本,很难快速把握缺口、保守位点和整体结构。DeepSeek Harness 的「工作区文件」虽然能打开这些文件,但内置预览更适合代码与文档,而不是多序列对齐的可视化阅读。

dsh-seq-viewer 在 DSH 右侧边栏注册「序列比对」标签页:从工作区树点击已认领的比对文件即可打开专用查看器,与「文件」「终端」等标签并列,切换或关闭后仍可保留视图状态。查看器基于 ReSeqt 改造,提供 Canvas 渲染,以及残基/保守性/一致性/单色配色、保守性直方图、一致性行、序列 Logo、搜索、排序、参考序列、跳转、缩放、选区复制、概览图与 PNG 导出等能力。除 FASTA(含 A2M/A3M)外,CLUSTAL、PHYLIP、Stockholm 等格式会在前端转换为 FASTA 再渲染,并支持对应 .gz 压缩;插件还会根据内容或后缀自动区分核酸与蛋白,也可在界面中切换配色。

文件只通过 DSH 会话授权在浏览器本地读取与解析,不经插件服务端路由,也不上传第三方。磁盘上的文件变化会通过资源版本提示「重新加载」;解析失败时可在标签内看到中文错误说明,并退回到文本预览或重试。你还可以在「工作区文件」标题栏配置认领哪些 glob,与 dsh-phylo-viewer 等插件并存时需注意不要对同一扩展名重复勾选。

适合在 DSH 中日常处理比对结果的生信研究者、课程实验与演示场景,以及希望在同一工作区里快速浏览 MSA、截图导出或核对位点而不离开 Harness 的用户。

使用场景

  • 在工作区文件树中点击 FASTA 或 CLUSTAL,于右侧栏快速浏览多序列比对
  • 核对保守位点、缺口与一致性行,并导出 PNG 用于报告或演示
  • 磁盘上的比对更新后按提示重新加载,必要时改用文本预览或重试

适合人员

  • 在 DSH 工作区中日常查看 MSA 的生信研究者
  • 需要在 Harness 内本地打开比对、注重隐私不上传的用户
  • 上课演示或实验批改比对结果的学生与教师