dsh-biorxiv
在终端中运行以下命令:
dsh plugin install TYEclipse/dsh-biorxiv
将以下提示词粘贴到 DeepSeek Harness 对话框中:
在 DeepSeek Harness 中执行 dsh plugin install TYEclipse/dsh-biorxiv,即可从 https://github.com/TYEclipse/dsh-biorxiv 安装本插件。
插件介绍
在生命科学工作流里,bioRxiv 预印本往往比正式发表更早出现,但分散在多个接口与页面之间,很难在 Agent 或脚本里稳定检索、核对版本,并导出成统一格式。dsh-biorxiv 面向 DeepSeek Harness,把预印本相关的常见操作收敛成一组工具,运行时零额外依赖,适合需要把文献检索嵌进对话或自动化流程的场景。
插件覆盖从主题检索到单篇 DOI 查询的完整链路:可按主题与可选日期、字段搜索预印本,默认用 minScore 过滤低置信文本匹配;通过 DOI 可查看最新版本、正式发表信息与撤稿标记(在数据源提供时)。还能按时间窗口拉取最新预印本,并把检索结果或单篇文献导出为 JSON、Markdown、CSV 或 BibTeX。biorxiv_digest 可生成结构化摘要式 Markdown,可选开启中文概要(需自行配置模型与 API 密钥,且明确标注为机器生成)。
数据侧以 Europe PMC 与 bioRxiv 公开 API 为主,期刊与撤稿等信息由 Crossref、OpenAlex 补充,部分失败不会阻断主流程;不提供全文 PDF 下载,也不绕过访问限制。当前为 0.1.0-alpha,相关性排序仍属试探性能力,预印本未经同行评议,不宜用于临床、医疗或投资决策。
适合科研人员、文献管理员、以及用 DSH 做课题调研、写综述或整理参考文献清单的开发者;若你已在用 MCP 或 CLI 编排工具,各命令返回统一的 JSON 信封,便于在流水线里判断成功与错误码。
使用场景
- 按主题与时间窗口检索 bioRxiv 预印本并筛掉低置信匹配
- 通过 DOI 核对最新版本、正式发表信息与撤稿标记
- 将检索结果或单篇文献导出为 Markdown、CSV 或 BibTeX 并生成结构化 digest
适合人员
- 需要把预印本检索接入 DSH Agent 或 MCP 的开发者
- 做课题调研与综述整理的科研与研究生用户
- 维护参考文献与阅读清单的图书情报或实验室助理