dsh-strawberry-data-hub
在终端中运行以下命令:
dsh plugin install 798645706/dsh-strawberry-data-hub
将以下提示词粘贴到 DeepSeek Harness 对话框中:
在已配置模型的 DeepSeek Harness 中执行 dsh plugin install 798645706/dsh-strawberry-data-hub,即可从 https://github.com/798645706/dsh-strawberry-data-hub 安装本插件。
插件介绍
草莓研究往往要跨文献、基因注释、表达与表观组、序列与变异等多套数据源,手工在网站间切换既慢又容易混用组装版本或坐标体系。dsh-strawberry-data-hub 把 Strawberry Data Hub 的能力接到 DeepSeek Harness,让你在对话里用自然语言完成检索、解析与导出,而不必记住每个模块的入口与参数格式。
插件通过 37 项工具覆盖从文献与证据核对、基因精确定位与功能注释,到转录组、表观组、单细胞、泛基因组、代谢组与 GWAS 等上下文查询;序列侧支持元数据查询、校验与 FASTA 导出,并可打开基因组浏览或共线性等分析视角。需要作图或位点预测时,BerryPlot 与 BerryLocus 先给出可审阅的草稿,经你在 DSH 中单独确认后再提交任务并取回结果,准备阶段不调用网站聊天模型、也不消耗网站试用额度。
适合在 DSH 里做草莓与相关病原体研究的科研与教学人员:日常查 DOI 与材料、批量注释基因表、核对文献中的数值与证据、或在本机拿到经过校验的序列与图件。若希望环境只保留数据查询能力,还可开启 researchOnly,将可用工具限定在本插件提供的 SDH 接口范围内。
使用场景
- 用自然语言检索草莓文献并整理 DOI 与研究材料
- 按基因 ID、物种与组装版本查询注释、表达与表观组上下文
- 准备 BerryPlot 热图或 BerryLocus 预测草稿,确认后提交并下载结果
适合人员
- 在 DSH 中开展草莓分子与育种研究的科研人员
- 需要跨模块查数据、做证据核对与批量基因注释的生信分析者
- 教学或演示场景下希望用对话访问 Strawberry Data Hub 的用户